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Problemas en Red Local

Que tal Soy Pablo de Mexico y me acabo de registrar para plantearles este problema:

En mi trabajo me desempeño en el area de Soporte Tecnico, no veo nada relacionado a sistemas esa es otra area de la empresa, bien no soy ningun experto, usuario avanzado ni medio en lo que es Windows Server en pocas palabras soy un novato pero me gusta aprender y debo hacerlo xD, el problema es este:

Tenemos instalado en el servidor principal el sistema que usan en la empresa, es Progress ahi lo diseñaron montaron la base de datos, etc. Bueno, tengo mas de 2 años trabajando ahi, al entrar mi responsabilidad fue checar las 12 computadoras que sirve para checar la asistencia de los usuarios, bueno tengo poco mas de 8 meses que se presenta una falla muy extraña, cierto tiempo esas computadoras me aparece el error de que se perdio la conexion con la base de datos del Servidor (como que es una desconexion de milisegundos, que dicho sistema no soporta y se cae) en estos ultimos meses ha estado pasando muy seguido, en el dia puede suceder de 3 a 4 veces, en ultimas semanas se cae a veces cada 2 hrs, la gente de sistemas me dice que es la red, de hecho una vez me paso cuando estaba con un usuario en el instante en que se salio el sistema y cheche: la red estaba bien, tenia acceso servidor, carpetas publicas, de hecho estaba trabajando con archivos de la red y en ningun momento se desconecto, solo el sistema que decia que perdio la conexion, algo que me paso ayer fue que me conecte via remota para reconectar esas 12 computadoras y hoy en la mañana no tuvieran problemas para checar asistencia, mi sorpresa fue que empeze a reconectar y en un momento dado (me conecto ya sea por vnc a la mi pc, o rdp via el server principal) y pasaba cierto tiempo y la conexion hecha hacia mi computadora o el servidor se perdia, el vnc se bloqueaba al igual que el escritorio remoto, volvia a entrar y pasaban no se unos 10min y volvia a bloquearse

tengo que mencionarles que el Servidor tiene 2 DD el disco duro donde esta windows tiene 2 particiones 1 de 50gb y la otra de 80gb, el software progress como su base de datos esta en la particion donde esta windows osea la de 50gb esa particion esta saturadisima, ha llegado a quedarse sin espacio en disco duro, el sistema tiene una carpeta donde vacian fotografias, que pesan cada una 10mb y hay miles desde que yo he estado ese server siempre ha tenido muy poco espacio, recuerdo que el max espacio que tuvo fueron 4gb, no se que este pasando si tenga un problema ese server, sea configuracion, o si sea ese sistema progress que es ajeno totalmente a mi (sistemas tiene soporte tecnico con esa empresa, pero ellos dicen que es la red, y sistemas no quiere hacer pruebas porque dice que es la red)

espero alguien me pueda ayudar